Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms