Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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