Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms