Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp49Q6P9L4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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