Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms