Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hvcn1Q3U2S8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hvcn1Q3U2S8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hvcn1Q3U2S8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hvcn1Q3U2S8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hvcn1Q3U2S8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms