Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Hbq1bQ3U0A6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hbq1bQ3U0A6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms