Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms