Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
XylbQ3TNA1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
XylbQ3TNA1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms