Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms