Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NfiaQ02780 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NfiaQ02780 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NfiaQ02780 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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NfiaQ02780 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms