Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pitx2P97474 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pitx2P97474 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms