Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSEN1P49768 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms