Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cox8bP48772 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms