Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfc1P35601 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfc1P35601 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfc1P35601 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms