Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SsbP32067 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SsbP32067 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SsbP32067 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SsbP32067 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SsbP32067 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SsbP32067 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SsbP32067 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SsbP32067 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms