Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms