Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6aP27664 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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