Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf8P23611 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms