Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN1P12814 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms