Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms