Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tgfb1P04202 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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