Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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BckdkO55028 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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