Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stag2O35638 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stag2O35638 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms