Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top6blJ3QMY9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Top6blJ3QMY9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms