Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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