Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6F6VAN0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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