Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm5538W4VSP6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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