Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn6Q9Z262 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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