Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tube1Q9D6T1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tube1Q9D6T1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms