Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PudpQ9D5U5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms