Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc47Q9D024 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ccdc47Q9D024 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ccdc47Q9D024 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ccdc47Q9D024 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc47Q9D024 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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