Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tdrd12Q9CWU0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tdrd12Q9CWU0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms