Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup155Q99P88 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms