Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp16Q99LG0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp16Q99LG0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms