Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lims1Q99JW4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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