Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med28Q920D3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med28Q920D3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms