Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf39Q8K2Z2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prpf39Q8K2Z2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Prpf39Q8K2Z2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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