Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms