Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Slc9b1Q8C0X2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc9b1Q8C0X2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Slc9b1Q8C0X2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc9b1Q8C0X2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc9b1Q8C0X2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms