Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hmgb4Q6P8W9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hmgb4Q6P8W9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms