Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23ipQ6NZC7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms