Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIRMAQ69YN4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms