Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms