Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms