Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eme2Q56A04 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms