Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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