Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl9Q32KG4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl9Q32KG4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl9Q32KG4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl9Q32KG4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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