Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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