Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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